Avslutning av MO-BiPS-prosjektet

Høsten 2019 er den siste med arbeid på MO-BiPS-prosjektet for meg. Jeg har reist regelmessig til Gjøvik fra 2013 og hatt mange hyggelige dager på sykehuset avbildet over.
Vi har oppnådd det vi hadde planlagt: Inklusjon av en kohorte pasienter med alvorlig fedme, et ph.d.-prosjekt, ph.d.-forsvar og noen ekstra artikler i etterkant.

To av de siste arbeidene fra kohorten som jeg er involvert i er i korrekturfase nå: Vi har en studie sammen med fedmeforskere fra OUS Aker der vi beskriver tarmsymptomer før og etter fedmebehandling, og en studie sammen med immunologisk avdeling på St. Olavs Hospital i Trondheim der vi ser på biomarkører for betennelse før og etter fedmebehandling. Begge kommer i open access-tidsskrifter, jeg deler dem her når de er offentlig tilgjengelige.

Genetikk og respons på intervensjoner

Funnene vi presenterte i Wien våren 2018 er nå publisert i tidsskriftet Obesity Surgery. Artikkelen handler om hvorvidt genetiske analyser kan brukes for å si noe om hvordan en pasient med sykelig overvekt vil respondere på fedmekirurgi. Svaret vårt er grovt fortalt "ja, de kan nok vise litt, men ikke nok til at det er klinisk nyttig".

Jeg synes det viktigste i artikkelen er at vi kan reprodusere en tidligere risikoscore for vekttap etter fedmekirurgi https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26832135  Reproduksjon er helt avgjørende i disse sammenhengene.

Allikevel: Nå i 2019 får man nok mer ut av å se hvordan ens mor eller søster reagerer på fedmekirurgi enn å kjenne hele sin gensekvens. Det er viktig å ta med i betraktningen at våre analyser bare er basert på noen få SNPs, steder i genomet der det finnes to ulike hyppige varianter - vi får se om framtida bringer muligheter for å også se på sjeldne varianter i slike tester.

Andre presentasjon

I mai 2018 fikk jeg gleden av å presentere på en internasjonal konferanse for andre gang. Denne gangen var temaet genetiske faktorer som påvirker vekttapet etter fedmekirurgi, konferansen var ECO 2018 i Wien.
Denne gangen representerte jeg Danmark, da funnene var gjort i et dansk materiale. Vi arbeider med manuskriptet nå høsten 2018.

Ph.d.-sammenstillingen

Alle tre artiklene vi har planlagt å ha med i ph.d.-avhandlingen er nå akseptert, og det til og med før de tre årene med lønnsmidler er brukt opp! Jubler litt over det og bruker nå all tid jeg kan finne på å jobbe med kappedokumentet. Stryker litt, sletter litt. Skal se hvor langt jeg kan nå til 1. mars.

Familie og klinisk jobb gjør at det ikke er mulig å grave seg helt inn i datamaskinen, men det er nok egentlig sunt. Skal skrive litt mer om enkeltartiklene her senere.

P values are not doing their job, because they can't

Og apropos p-verdier: Denne er meget god om hvordan vi tenker om data.

http://www.nature.com/news/scientific-method-statistical-errors-1.14700

Fedmekonferanse

Forsinket liste med interessante bruddstykker fra europeisk fedmekonferanse:
- Overvektskirurgi går seiersgang i mange land - bortsett fra i Danmark der de nylig har økt BMI-grensene for operasjon. Fedmefagfolkene i Danmark er misfornøyde med beslutningen.
- Predimed-studien har data som tyder på at middelhavskosthold også kan ha effekt på brystkreft. Men var dette et prespesifisert endepunkt? Type 1-feil?
- Mye snakk om gangen fra uheldig kosthold til systemisk inflammasjon til følgesykdom.

Et randomisert, kontrollert forsøk

En kan argumentere for at også sykepleierstudenter bør lære en del om kvantitative forskningsmetoder. Her er den morsomste undervisningstimen jeg hadde da jeg underviste mikrobiologi i Oslo for noen år siden:

Klassen ble delt inn i tre grupper og randomisert til tre ulike tiltak med hendene: Vask, desinfeksjon eller ingenting.
Resultatene ble ganske konsistente: Sprit kom best ut hver eneste gang, å ikke vaske kom dårligst ut.

Tolkningen ble gjort 48 timer etter av en tilfeldig annen student i klassen, som ikke visste hva forsøkspersonen med det aktuelle nummeret på skålen hadde gjort to dager før.

Det er selvsagt en del metodeproblemer, men mye av vitsen med undervisningen er nettopp å diskutere det.

PDF-bibliotek

Trenger en løsning for et PDF-bibliotek de kommende årene. Helst et ryddig, enkelt brukergrensesnitt der det er enkelt å legge filene over, der det er mulig å skrible og gule ut i selve dokumentene.

Fire forslag kommer fra flere hold:

• Papers
• GoodReader
• Mendeley
• iAnnotate

Skal teste litt de neste ukene.